Wolverine : Le Combat de l'immortel (2013)

Août 1945, Logan est incarcéré dans un camp de prisonniers de guerre japonais. Alors qu'une alerte à la bombe retentit, l'officier Ichirō Yashida décide de libérer les prisonniers. Logan est quant à lui enfermé au fond d'un puits. Alors que les autres officiers se tuent par hara-kiri, Yashida suit Logan au fond du puits alors que survient le bombardement de Nagasaki. Malgré la force de l'explosion, grâce à l'intervention de Logan, Yashida est sauvé.

En 2013, Logan vit désormais reclus dans les montagnes et fait difficilement le deuil de Jean Grey, dont il fait régulièrement des cauchemars. En ville, il est approché par Yukio, une mutante capable de lire l'avenir et de voir la mort des autres. Elle lui apprend qu'Ichirō Yashida est mourrant et qu'il veut absolument le voir. Logan se rend ainsi à Tokyo pour faire ses adieux à l'ancien officier.

Arrivé au Japon, Logan fait la connaissance de la famille de son ami : son fils Shingen ainsi que la fille de ce dernier, Mariko. Il rencontre par ailleurs le Green, la cancérologue et médecin personnel, rencontrée un an plus tôt. Yashida lui révèle qu'il le considère comme un rōnin à cause de sa capacité à guérir et que cela le condamne à vivre éternellement, ce que Yashida interprète comme une malédiction. Aussi, il lui propose un marché : en échange de sa capacité à guérir, il s'engage à rendre Logan mortel. Ce dernier se montre réticent et surpris par cette idée.

La nuit suivante, alors que Logan rêve qu'il embrasse Jean Grey (qui s'attendait à ce qu'il accepte la proposition de Yashida), il se fait attaquer par Green qui lui injecte quelque chose dans le corps par la bouche. Mais Logan se réveille et pense avoir rêvé.

En septembre 2009, Gavin Hood, le réalisateur d' X-Men Origins: Wolverine a spéculé qu'il y aurait une suite qui se déroulera au Japon.

À l'origine, le film devait s'intituler X- Men Origins: Wolverine 2 et ainsi être la suite de X-Men Origins: Wolverine, sorti en 2009. Rapidement, il est annoncé que l'histoire se déroulera au Japon, tout comme une série de comics sur Wolverine par Chris Claremont et Frank Miller publiée dès 1982. Hugh Jackman avoue alors que ces comics sont ses préférés. La productrice Lauren Shuler Donner approche alors le scénariste Simon Beaufoy, qui décline la proposition. Le 5 mai 2009 au cinéma, 4 jours après la sortie américaine de X-Men Origins: Wolverine, la suite est officiellement confirmée.

En août 2009, Christopher McQuarrie, qui avait travaillé de manière non créditée sur X-Men de Bryan Singer, est engagé pour écrire le script du film. L'histoire est alors focalisée sur la relation entre Logan/Wolverine et Mariko Yashida.

À l'origine, Bryan Singer s'est vu offrir l'occasion de réaliser le film, mais il a refusé. Des rumeurs évoquent alors les noms de Daniel Espinosa, Timur Bekmambetov, Kathryn Bigelow, Tony Scott ou encore Matt Reeves. En octobre 2010, c'est finalement Darren Aronofsky qui est officialisé comme réalisateur du projet. L'une de ses premières décisions est de renommer le film en The Wolverine, pour en faire un film indépendant à la saga plutôt qu'une simple suite.